Esta sección consta de 1468 volúmenes, que abarcan los años 1591-1976.

Los manuscritos que la conforman se encontraban sueltos, durante el periodo novohispano, acumulándose por largo tiempo, en la segunda mitad del siglo XIX, el señor Manuel Aguilar y Covarrubias, secretario del Ayuntamiento, dedicó varios años a la ordenación de los documentos, los clasificó por asuntos y dispuso su encuadernación con el título genérico de expedientes; los cuales se trató de ordenar por ramos, con cierto orden cronológico. Posterior a este personaje la ordenación de los expedientes se realizó en diferentes épocas por distintas personas y con criterios de organización poco homogéneos. Contiene expedientes con asuntos diversos tratados en el Ayuntamiento poblano, como son obra pública, tierras, gremios, fiel ejecutoria, diversiones, milicia, exámenes, inspección, avalúos, inventarios, padrones, correspondencia sanidad, educación, festividades cívicas, gastos municipales y otros, que reflejan la historia de la ciudad en sus diferentes facetas. Existen expedientes que cuentan con planos, croquis, ilustraciones, folletos, bandos, periódicos, recibos de casas comerciales, propaganda, invitaciones, programas y otros.